日時： 2021年10月25日13:00-17:00
チュートリアル参加費：無料　ただし、CBI学会2021年大会への参加登録(有料)が必要です。

開催趣旨：
　フラグメント分子軌道（FMO）計算結果を収載したFMOデータベース(FMODB; (https://drugdesign.riken.jp/FMODB/) は、2019年2月の一般公開以来データ数を増やし、8月16日時点で13230構造を公開している。最近では新型コロナウイルス感染症（COVID-19）特集ページを開設するなどの取り組みが広がっている。本セッションでは、FMODBの概要を紹介するとともに、実際にFMODBに登録されているデータを用いて、創薬研究に用いるための解析方法について紹介する。FMODBの詳細を知りたい方、実際にFMO計算結果を解析してみたい方のご参加をお待ちします。

モデレーター：
福澤 薫　Kaori Fukuzawa（星薬科大学 Hoshi University）
高谷 大輔　Daisuke Takaya（理化学研究所 RIKEN BDR）

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1. はじめに　13:00-13:05
    福澤 薫　Kaori Fukuzawa （星薬科大学  Hoshi University）

2. FMODBの最新の開発状況と機能の紹介　13:05-13:40
    高谷 大輔　Daisuke Takaya （理化学研究所生命機能科学研究センター RIKEN BDR）

量子化学計算の一つであるFMO法により得られる相互作用エネルギー(IFIE/PIEDA)はタンパク質-リガンド間相互作用解析及び創薬研究への応用が期待されている。私たちのグループではFMO計算データの蓄積を目的としたFMODBを開発し、FMODDコンソーシアムのメンバーによる計算、自動化前処理プロトコールで計算された結果等のFMOデータを閲覧するための簡便なインターフェイスをホームページから提供している。本セクションではFMODBが提供する機能や最新の開発状況について紹介したい。

休憩 13:40-13:50

3.＜チュートリアル＞FMODBを活用したリガンド-タンパク質間相互作用解析　13:50-14:50
　半田 佑磨　Yuma Handa（星薬科大学　Hoshi University）

FMODBに収載されている、タンパク質―リガンド複合体の登録データを用いた解析を行う。COVID-19関連タンパク質であるMain proteaseや、エストロゲン受容体(ER) β複合体の計算結果を例に、FMODBのwebインターフェイスおよびFMO専用GUI のBioStation Viewerを使用したIFIE/PIEDA解析の流れを解説し、リガンド結合性の評価や重要な相互作用の抽出について実践する。

休憩 14:50-15:10

4. ＜チュートリアル＞FMODBを活用したタンパク質-タンパク質間相互作用解析　15:10-16:10
　渡邉 一樹　Kazuki Watanabe（千葉大学　Chiba University）

タンパク質－タンパク質間相互作用の例として、COVID-19関連タンパク質であるSpikeタンパク質と抗体との結合性について、FMODBのwebインターフェイスおよびBioStation Viewerを用いた解析を実践する。さらに、FMO計算による結合エネルギーとIC50との相関解析についても実施する。

休憩　16:10-16:20

5. FMODBの進捗と今後の課題　16:20-16:40
    渡邉 千鶴　Chiduru Watanabe（理化学研究所生命機能科学研究センター, JSTさきがけ RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research, JST PRESTO）

FMODBデータ蓄積において高分解能X線結晶構造データの収集や、GAMESSデータのFMODD登録に向けた取り組みなどの進捗を紹介する。また、FMO創薬コンソーシアムの活動の一環として、富岳を利用したMDスナップショットやドッキングデータ等の一連の大規模FMO計算のデータの登録が今後加速することが予測されるため、そのような大規模データの取り扱い等、今後のFMODBの開発に向けた課題を紹介する。

6. 総合質疑応答＆個別相談　16:40-17:00