日時： 2022年10月24日13:00-17:00
チュートリアル参加費：無料　ただし、CBI学会2022年大会への参加登録(有料)が必要です。

開催趣旨：
　フラグメント分子軌道（FMO）計算結果を収載したFMOデータベース(FMODB; (https://drugdesign.riken.jp/FMODB/) は、2019年2月の一般公開以来データ数を増やし、8月10日時点で14,924構造を公開している。最近では、富岳等のスパコンを用いたMDスナップショット等の大規模データを用いたFMO計算が始まっている。また、創薬ターゲットタンパク質に限らず、核酸等の様々な生体高分子に対してのFMO解析及びデータ収集の取り組みが広がっている。本セッションでは、FMODBの概要を紹介するとともに、実際にFMODBに登録されているデータを用いて、創薬研究に用いるための解析方法について紹介する。FMODBの詳細を知りたい方、実際にFMO計算結果を解析してみたい方のご参加をお待ちします。

モデレーター：
加藤　幸一郎　Kouichiro Kato（九州大学　Kyushu University）
高谷 大輔　Daisuke Takaya（大阪大学 Osaka University）
渡邉千鶴　Chiduru Watanabe（理化学研究所　RIKEN BDR）

---

1. 13:00-13:05
はじめに
　 高谷 大輔　Daisuke Takaya （大阪大学 Osaka University）

2. 13:05-14:35
＜チュートリアル＞ FMODBの紹介、動的平均FMOリガンド–タンパク質間相互作用解析
　 神坂 紀久子　Kikuko Kamisaka （理化学研究所生命機能科学研究センター RIKEN BDR）

量子化学計算の一つであるFMO法により得られる相互作用エネルギー(IFIE/PIEDA)はタンパク質-リガンド間相互作用解析及び創薬研究への応用が期待されている。私たちのグループではFMO計算データの蓄積を目的としたFMODBを開発し、FMODDコンソーシアムのメンバーによる計算、自動化前処理プロトコールで計算された結果等のFMOデータを閲覧するための簡便なインターフェイスをホームページから提供している。本セクションではFMODBが提供する機能や開発状況について紹介する。また、最新の機能としてMDスナップショットのような一連のデータセットに対するリガンド–タンパク質間のIFIE/PIEDA解析を行い、構造揺らぎを考慮した動的平均IFIE/PIEDAと活性値との相関を導出する。

14:35-14:55 休憩

3. 14:55-16:25
＜チュートリアル＞FMODBを活用したリガンド-核酸-タンパク質間相互作用解析
　 宮川 柊兵　Shuhei　Miyakawa（星薬科大学　Hoshi University）

リガンド‐核酸‐タンパク質の複合体における相互作用解析について、COVID-19関連タンパク質であるRNA依存性RNAポリメラーゼ（RdRp, RNA dependent RNA Polymerase）とレムデシビルの複合体を例に、FMODBのwebインターフェイスおよびBioStation Viewerを用いた解析を行う。関連研究の最新動向を紹介すると共に、核酸を含む系の相互作用解析に必須となるラダー図の作成などを実践する。

4. 16:25-16:35
まとめ　
　 加藤 幸一郎　Koichiro Kato（九州大学　Kyusyu University）

5. 16:35-17:00
個別相談等　

*各チュートリアルの途中で適宜休憩をはさむ予定です。