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「CBI若手研究者のための、夏のフロンティア探索シリーズ」
猛暑の中、人材育成に、明日のBioinformaticsに、熱い議論が交わされた CBI学会は、8月18日―20日の3日間にわたり、夏季特別研究集会「CBI若手研究者のための、夏のフロンティア探索シリーズ」を開催した。全体を企画したのは神沼二眞事務局担当理事であるが、田中博理事（東京医科歯科大学教授）、小長谷明彦理事（理研遺伝子ネットワークモデル化研究チームリーダー）の協力をえている。また多田幸雄会長（大鵬薬品工業）、堀内正法人賛助会員代表（第一製薬）にも特別に参加していただくなど、CBI学会の強みを生かした企画であったが、急速に進展しているバイオインフォマティクスという新しい分野においてどのような研究が展開されているのか、またそこで必要とされる知識技能とは何であるかを理解する上で大変有意義な会となったと思われる。これからこの分野をめざしている若手の研究者、あるいは実際に研究を行っている方にとっても、最先端において活躍されている研究者の方々の話を聞けたことは、大きな刺激となったようである。時期的にお盆休みということもあり、準備段階では、参加者が少ないことが懸念された。しかし、関係者が宣伝してくださったこともあり、３日間とも記録的な猛暑の中にもかかわらず盛況であり、CBI学会らしく闊達な議論が交わされたことは大きな収穫だった。このような会合が多くの優秀な人材を生み出す手助けとなることを強く願い、参加された方々のこれからの活躍を期待したい。以下簡単にそれぞれの会合について報告する。なお、基調資料、講演者の許可をえた講演資料も参照されたい。 (１) ８月１８日 人材育成シンポジウム「先端的学際領域の専門教育と仕事の機会」 於：日本化学会 化学会館7Fホール (２) ８月１９日 Tutorial「Bio Pathway/Network入門」 於：理化学研究所 横浜研究所 (３) ８月２０日 研究講演会「Omicsと大規模データの解析」 於：理化学研究所 横浜研究所 |
8月18日：「先端的学際領域の専門教育と仕事の機会」（18日基調資料）
初日である１８日の会合は、神保町の日本化学会化学会館で、人材育成シンポジウムとして、「先端的学際領域の専門教育と仕事の機会」と題して開催された。最近IT、ゲノム、ナノなどの言葉が、先端的な技術分野として、マスメディアを賑わしている。この分野の専門家を志す学生や若手研究者も少なくない。こうした分野の専門性をどう身につけていくか、最初の仕事の口をどう探したらよいか、さらに任期つきの雇用条件の下で次の職をどう探すか、さらに一度就職しても自らの天職を求めてどう転職していくかなどについて、悩んでいる学生や若手研究者は少なくないであろう。CBI学会の人材育成事業の一環であるこのシンポジウムは、こうした問題に関する関係者、経験者をお招きして話を聞くことにより、広く状況を把握しながら考える機会を提供することをめざした。初めに、世話人である神沼理事から、この会の趣旨、CBI学会の活動目標についての説明があった。会の趣旨については冒頭に述べたが、活動目標については、今までCBI学会は、研究講演会開催、年次大会開催、CBIジャーナル発行、研究開発事業の推進などをかかげ、着実に実現してきたが、今後は、人材育成にも力を入れたいと思っているとの話があった。そしてその一環として、今回の会が開催されたわけである。現代は学ぶということが大切な時代、学ぶことと働くことが密接にリンクしている時代で、CBI学会は学ぶという点に関しても、働くという点に関しても、重要な役割を果たしていくことが求められると考える。（神沼理事資料）
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（このプログラムの詳細は、http://minerva.chem.sci.hiroshima-u.ac.jp/NaBiT/NaBiTj.html）
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なお、シンポジウム終了後、懇親会が開かれた。参加者は、講師の方々を交えて活発な議論がなされたようである。今回のシンポジウム参加者は約60名で、若手の研究者、学生の方々が多数参加され、充実したシンポジウムが持てたと思う。今回がはじめての企画であるが、これからもCBI学会の今後の活動の一環として、このような会を続けて欲しいという意見が多かった。（文責、CBI学会事務局 小宮山直美）
8月19日：Tutorial「Bio Pathway/Network入門」（19日基調資料）
細胞における物質代謝、分子信号伝達、遺伝子制御という３つのPathway/Networkの解明は、ヒトゲノム解読計画後の生物学の重要目標としていわゆる-omics技術などを駆使して急ピッチで解明が進んでいる。それに伴い、それらのデータや知識を体系的に整理するPathway/Networkのデータベースづくりとそれに基づいた生体応答のモデルづくりが、バイオインフォマティクスの重要課題となった。ここで問題となるのは、そうしたデータベースやモデル開発の目的である。90年代の初めからPathway/Network の重要性を指摘し、先駆的なシステムを紹介してきたCBI学会は、この２年ほど、Pathway/Network to Diseaseを標榜してシリーズで研究講演会を開催してきたが、我が国のこの分野の人材の薄さが大きな問題だと認識するに至った。 そこでこの教育講演会は、この分野のシステム開発では世界的な先駆者である東京大学の高井貴子博士と東京医科歯科大学の田中博研究室、理研小長谷明彦研究室の協力を得て、この分野の戦力となりうる研究者育成を目指すべく、8月19日のTutorial「Bio Pathway/ Network 入門」および20日の第245回CBI研究講演会「Omicsと大規模データの解析」を併せて開催した。その初日にあたる１９日の講演は、以下のとおりである。
| ・「ヒトゲノム情報へアクセスするためのブラウザーについて」 田中義智氏（東京医科歯科大学） ・「タンパク質相互作用データベースへアクセスするためのブラウザーについて」 長谷武志氏（東京医科歯科大学） ・「ゲノム研究におけるオントロジーの開発と利用」 高井貴子氏（東京大学） ・「バイオインフォにおける代謝経路を含むネットワークの重要性」 長谷川義和氏（理化学研究所） |
その内容について簡単に報告する。東京医科歯科大学の大学院生である田中義智氏および長谷武志氏は、それぞれ自身の研究における手法をもとに、必要な情報データベースをどのように活用、駆使しているかを実践的な立場からわかりやすく解説をした。これらの解説は、これからこの分野を研究する方々にとり、まず必須となる基本的なデータベースへのアクセス法を知るために有意義なものであった。
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続いて、東京大学の高井貴子氏は、オントロジーとはいったい何であるのか、情報科学、計算機科学における元来のオントロジーの意味と生物学およびゲノム研究におけるオントロジーについて、また実際にゲノム研究にオントロジーがどのように使われ、今後の研究には何が必要なのかについて詳しく説明された。生物学においては研究成果を解釈し、概念を獲得、解析し、仮説をたてるという作業が行われてきたが、ゲノム研究の登場により概念が爆発的に増加し人間の頭では処理が不可能な状況になってきた。そこで計算機に概念の処理をさせる技術、環
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8月20日：「Omicsと大規模データの解析」
Omicsとは、DNAチップ（Transcrptomeの網羅的解析）、Proteomics, Metabolomics/ Metabonomics 、タンパク質相互作用などに代表される、ゲノム解析に関連した網羅的解析技術のことである。こうした技術の適用範囲は、拡大を続けながら、分子生物学の基礎から、毒性予測、医薬品開発、臨床におけるまで、もはや必須の技術になっている。しかし、これらの実験や試験から産生される膨大なデータの解析と解釈には、コンピュータの支援が不可欠である。こうした技法は一般にデータマイニングと呼ばれる。しかし従来のデータ解析の延長では極めて不十分であり、専門知識が深く解析に介在しなければならない。とくに注目されてきたのがＣＢＩ学会が強調してきたPathway/Networkのような知識システムを動員することである。このような視点を加味して、さまざまな新しい分野で活躍されている講師をお招きし、以下のような講演をしていただいた。
| ・「生命知識科学：生命知識に基づくＯＭＩＣＳの解明」 小長谷明彦（理化学研究所ゲノム科学総合研究センター） ・「免疫情報学の立ち上げについて 」 Christian Schonbach（理化学研究所ゲノム科学総合研究センター） ・「ベイジアンネットによるデータマイニングと確率推論 --その基礎と事例紹介--」 本村陽一（産業技術総合研究所） ・「免疫・アレルギー科学総合研究センターの紹介」 小原 收（かずさDNA研究所、理化学研究所） ・企業発表 |
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Schonbach氏は、ImmunoinformaticsというBioinformaticsにおける新しい領域を立ち上げていることを話された。Immunoinformaticsの第１回の会合は、Novartis Foundationの支援で、２００２年の１０月のロンドンで開催された（この会議録は、Immunoinformatics: Bioinformatic Strategies for Better Understanding of Immune Functionと題して最近、出版されている）。その後、２００４年の２月の理研で
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次に本村陽一氏（産業技術総合研究所）がベイジアンネットについて話をされた。知的システム構築において、ヒトの不確実性を定式化するのは困難である。そこでベイジアンネットを用いたモデル化による、確率推論、統計的学習などが有効となる。データのモデル化から予測を行う上での基礎的なベイジアンネットの手法やその特徴を解説、さらに実際の事例からベイジアンネットがどのように利用され、どのような効果を持つのか、様々な領域での研究の現状が詳しく解説された。また知識データベースとの組み合わせによるモデル化への取り組みや現在の課題などについて取り上げられ、ベイジアンネットへの理解が深められる内容であった。（本村氏資料）
小原收氏（かずさDNA研究所、理化学研究所）は、同センターの紹介と免疫系システムの解明におけるOmics的ゲノム解析のあり方などについて話された。免疫・アレルギー科学総
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最後の企業発表のセッションでは、Pathway/Networkに関連した製品を出しておられる企業からツールの紹介と実際の活用事例などを発表していただいた。これらは、単に商品の紹介でなく、研究者にとって大変有用な情報でもあった。発表演題と企業は以下のとおりである。生物情報統合プラットホームKeyMolnet、株式会社医薬分子設計研究所； ２次元電気泳動を用いたプロテオームデータベース開発、東和科学株式会社； 遺伝子発現解析における新たなクラスタリング手法、ＮＴＴコムウェア株式会社；PubGene Database、三井情報開発株式会社； パスウェイ解析ソフト『PathwayAssist』およびPathwayAssistと連携するネットワーク推定ソフト『ASIAN』、インフォコム株式会社。（文責、CBI学会事務局 湯川真澄）
情報計算化学生物学会（CBI学会)事務局
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