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プログラム
　　　　

11月8日（火）1日目
  メイン会場（301） サブ会場1（401） サブ会場2（402）
　 受付開始
＜開会の辞＞        
10:00-10:20 開会の挨拶 　   　   　
＜基調講演＞        
10:20-11:10 K-01: 平尾公彦（(独)理化学研究所）
"The K Supercomputer and Recent Advances in DFT"
  座長: 田中成典（神戸大学）		 英   　   　
11:10-12:00 K-02: Thom Dunning（Univ. of Illinois）
"Future of High Performance Computing"
  座長: 中馬 寛（徳島大学）		 英   　    
＜ランチョンセミナー1＞
パトコア株式会社		 ポスター発表（奇数ID: 於ポスター会場）
12:30-13:30    
＜高性能計算化学＞ 座長: 江口至洋（理化学研究所）　 ＜JSBi口頭発表＞ Session 1-1
   14:00-15:28		 ＜スポンサードセッション＞
 geneXplain GmbH
14:00-14:30 I-01: 森下真一（東京大学）
「パーソナルゲノムと DNA 高次構造解析における高性能計算」 		日 14:00- 
(JSBi-25)Wataru Iwasaki (Univ. of Tokyo)
"TogoDoc server/client system: smart recommendation and efficient management of life science literature"
14:22- 
(JSBi-32)Yasumasa Shigemoto (NIG)
"Knowledgebase of influenza virus by DDBJ RDF"
14:44- 
(JSBi1-48)Chie Motono(CBRC)
"SAHG, a comprehensive database of predicted structures of all human proteins, and structure prediction pipeline for eukaryotic proteins"
15:06-  
(JSBi-55)Kana Shimizu (CBRC)
"Privacy preserving search for chemical compound libraries"		 英 Edgar Wingender (Goettingen Univ.)
14:00-14:30 
生物活性予測の画期的ツール
14:30-15:00 
geneXplain: データ解析からシミュレーションまで
15:00-15:30 
上記システムによる新規乳がん治療薬の同定		 英
14:30-15:00 I-02: 藤谷秀章（東京大学）
「超並列結合自由エネルギー計算を用いた薬開発」 		日
15:00-15:30 I-03: 杉浦清了（東京大学）
「分子機能に基づいたマルチスケール心臓シミュレータ」 		日
＜生命動態＞座長: 泰地真弘人（理化学研究所） ＜JSBi口頭発表＞Session 1-2
 16:00-17:06		 ＜スポンサードセッション＞
 PDBj (日本蛋白質構造データバンク)
16:00-16:30 I-04: 柳田敏雄（(独)理化学研究所）
「ゆらぎと生命機能」		 日 16:00- 
(JSBi-15)Mihoko Saito(Nagahama Institute of Bioscience and Technology)
"Classification of PDB ligands with fast graph matching algorithm"
16:22- 
(JSBi-26)Hajime Hanawa (Waseda University)
"Analysis of intrinsically disordered proteins based on molecular evolution"
16:44- 
(JSBi-36)Yoichi Murakami(National Institute of Biomedical Innovation)
"Exhaustive comparison of representative partial surfaces of ligand binding sites in proteins"		 英 Biological and Chemical Databases: Application and Integration
Organizer: Haruki Nakamura (Osaka Univ.)

16:00-16:30 
Akira R. Kinjo (Osaka Univ.)
"Protein Data Bank on the Semantic Web"
16:30-17:00 
Kengo Kinoshita (Tohoku Univ.)
"COXPRESdb: A database of gene coexpression in seven model animals"
17:00-17:30 
Takeshi Kawabata (Osaka Univ.)
"KCOMBU: a chemical structure comparison tool using the build-up MCS algorithm"

 英
16:30-17:00 I-05: 森貴治（(独)理化学研究所）
「分子シミュレーションによる膜タンパク質のダイナミクス解析」		 日
17:00-17:30 I-06: 柴田達夫（(独)理化学研究所）
「走化性細胞における細胞の自発的な極性形成と勾配認識」 		日
 

11月9日（水）2日目
　 メイン会場（301） サブ会場1（401） サブ会場2（402）
＜基調講演＞        
9:30-10:20 K-03: 大谷光昭（塩野義製薬株式会社）
「ケモバイオインフォマティックスとメディシナルケミストリーの協調による画期的創薬への期待」
  座長: 坂田恒昭（大阪大学）		 日   　   　
10:20-11:10 K-04: Thierry Langer (Prestwick Chem.,Inc.)
"Feature-based Pharmacophore Models for Bio-Activity Profiling: An Interesting Concept for Efficient Lead Optimization"
  座長: 小長谷明彦（東京工業大学）		 英   　   　
11:10-12:00 K-05: Ross King (Aberystwyth Univ.)
"Automating Biology using Robot Scientists"
  座長: 阿久津達也（京都大学）		 英   　   　
＜ランチョンセミナー2＞
エルゼビア・ジャパン株式会社		 ポスター発表（偶数ID: 於ポスター会場）
12:30-13:30 Dr. Jochen Tannemann (Elsevier Information Systems GmbH, Sr. Sales Development Manager)
海附玄龍(エルゼビア・ジャパン株式会社プロダクトセールスマネージャー) 		 
＜アカデミアにおけるインシリコ創薬支援技術の最前線＞
  座長: 広川貴次（産業技術総合研究所）
    共催：JSBi創薬インフォマティクス研究会		 ＜JSBi口頭発表＞Session 2-1
 14:00-15:28		 ＜スポンサードセッション＞
株式会社日立ソリューションズ
14:00-14:30 I-07: 水口賢司（(独)医薬基盤研究所）
「統合データウェアハウスTargetMineを用いた疾患関連遺伝子の絞り込みと検証」 		日 14:00- 
(JSBi-12)Edward Wijaya(Univ. of Tokyo)
"Protein-coding based assembly of metagenomic next-generation sequencing data"
14:22- 
(JSBi-27)Daisuke Ueta (Osaka Univ.)
"Mutation-aware clustering with error correction for short-read genome mapping"
14:44- 
(JSBi-39)Masahiro Hamano (Japan Science and Technology Agency)
"Kinetic simulations of RNA-interference: primer dependent and independent synthesis of dsRNA"
15:06- 
(JSBi-47)Wataru Fujibuchi (Computational Biology Research Center)
"Prediction of chemical toxicity by network-based SVM on ES-cell validation system"		 英 14:00-15:00
黒川顕（東京工業大学）
「ゲノムからメタゲノムへ」
15:00-15:30
Trevor Wagner(OpGen, Inc.)
"Optical Mapping:Innovative platform for whole genome analysis" 　 		 
14:30-15:00 I-08: 福西快文（(独)産業技術総合研究所BIRC）
「ドッキング、スクリーニングと周辺の課題」 		日
15:00-15:30 I-09: 秋山泰（東京工業大学）
「機械学習を用いた薬物のクリアランス経路予測」		 日
＜薬物動態＞座長: 水間俊（東京薬科大学） ＜JSBi口頭発表＞Session 2-2
 16:00-17:28		 ＜神戸市市民講座＞
「健康をささえるスパコン「京」」
16:00-16:10 I-10: 水間俊（東京薬科大学）
「医薬品開発の鍵を握るADMETのdry study （e-ADMET）への展開に向けて」		 日 16:00- 
(JSBi-3)Kazuhiro Takemoto (Japan Science and Technology Agency)
"Estimating metabolic network robustness using branching process approximation"
16:22- 
(JSBi-42)Mitsunori Kayano (Univ. of Tokyo)
"A partial correlation approach for estimating metabolic networks from multi-omics data"
16:44- 
(JSBi-62)Edgar Wingender (Goettingen Univ.)
" "Seed sites" constitute a reliably predictable core transcription network"
17:06-
(JSBi-13)Kentaro Inoue(Kyushu Institute of Technology)
 "Hybrid grid layout algorithm for biochemical network maps" 		英 江口至洋（(独)理化学研究所）
「世界最速のスパコン「京」」
坂田恒昭（大阪大学）
「薬創りに活躍するスパコン」
野村泰伸（大阪大学）
「医療の世界で活躍するスパコン」 		 
16:10-16:50 I-11: 山本昌（京都薬科大学）
「ペプチド・タンパク性医薬品の消化管ならびに経粘膜吸収性の改善」 		日
16:50-17:30 I-12: 堀江利治（千葉大学）
「酸化ストレス誘発性肝障害と薬物動態」 		日
18:00～   ＜バンケット＞（レセプションホール）　　　　　
 

11月10日（木）3日目
　 メイン会場（301） サブ会場1（401） サブ会場2（402）
＜オープンイノベーション＞座長: 坂田恒昭（大阪大学） ＜JSBi口頭発表＞Session 3-1
 9:00-10:28 		＜スポンサードセッション＞
株式会社パーキンエルマージャパン
9:00-9:30 I-13: 松本弥生（塩野義製薬株式会社）
「医薬品業界におけるオープンイノベーションの取り組み」		 日 9:00- 
(JSBi-8)Shuhei Kaneko (Tokyo Univ. of Science)
"Gene selection using a high-dimensional Cox model in microarray data analysis"
9:22- 
(JSBi-46)Sung-Joon Park (Univ. of Tokyo)
"Transcriptome analysis of mouse early embryo development by RNA sequencing"
9:44-
(JSBi-2)Yoshihiko Hasegawa (Univ. of Tokyo)
"Analysis of positive feedback in genetic oscillators"
10:06- 
(JSBi-14)Daniel Berrar (Tokyo Institute of Technology)
"The area under the ROC curve: an incoherent performance measure for biomedical classifiers"		 英 9:00-9:50
丸尾敏男
「パーキンエルマー電子実験ノートについて」
9:50-10:05
清水英樹
「研究環境に必須のDrawingツール　ChemBioDrawのご紹介」
10:05-10:30
塩田良
「Columbus™: 画像データの解析・保存・管理システム」 		 
9:30-10:00 I-14: 塚本芳昭（(財)バイオインダストリー協会）
「アジア連携によるオープンイノベーションの推進」		 日
10:00-10:30 I-15: 山本貴史（株式会社東大TLO）
「オープンイノベーションをエンカレッジさせる産学連携」		 日
＜橋渡し研究＞座長: 田中博（東京医科歯科大学） ＜JSBi口頭発表＞Session 3-2
 10:40-11:46		 ＜口頭発表セッション＞
10:40-11:10 I-16: 田中博（東京医科歯科大学）
「疾患システムバイオロジーの現状と将来」		 日 10:40- 
(JSBi-20)Kengo Sato (Keio Univ.)
"Simultaneous aligning and folding of RNA sequences by dual decomposition"
11:02- 
(JSBi-50)Hiroaki Iwata (Kyoto Univ.)
"Evaluation of spliced alignment programs using cross-species benchmark datasets"
11:24- 
(JSBi-58)Yoshinori Fukasawa (Univ. of Tokyo)
"MoiraiSP: a novel mitochondrial cleavage site predictor"		 英 「核内受容体研究における実験と計算のインターフェイス」
オーガナイザー：田中成典（神戸大学）

10:40-11:10
菅野美津子（東芝研究開発センター）、宮城慧（豊橋技術科学大学）
「AhRとダイオキシン類の特異的相互作用の解析」
11:10-11:40
松島綾美、下東康幸（九州大学）
「化学物質の核内受容体への強い結合を誘導するCH/π相互作用」
11:40-12:10
福澤薫（みずほ情報総研）
「核内受容体による転写制御のメカニズム～フラグメント分子軌道法による量子化学計算解析～ 」

 日
11:10-11:40 I-17: 中川原 章（千葉県がんセンター）
「World Community Grid 分子イメジングによる癌の新薬探索」		 日
11:40-12:10 I-18: 鈴木 亨（東京大学）
「プロテオームのトランスレーションへの挑戦ー 心血管疾患のバイオマーカーの探索と臨床応用」		日
12:10-12:30  ＜ポスター賞授与式（CBI & JSBi）＞　   　   　
＜ランチョンセミナー3＞
株式会社ワールドフュージョン		  
12:30-13:30 「最新ナリッジ活用最適化システム・進化したLSKB」
川原 弘三
「NGSアノテーション管理システムとしてのLSKB」
緑川 淳
「ナリッジと構造デザイン機能を組み合わせたリード候補探索」		    
＜特別講演＞        
14:00-14:50 I-19: 後藤 修（京都大学）
「配列アラインメントのこれまでとこれから」
  座長: 松田秀雄（大阪大学）		 日 　 　 　 　
14:50-15:40 I-20: 金久 實（京都大学）
「知的財産としてのバイオインフォマティクス」
  座長: 松田秀雄（大阪大学）		 日   　   　
15:40-16:30 I-21: 神沼二眞（サイバー絆研究所）
「CBI、2040年をめざして－研究と職の新しい可能性」
  座長: 田中博（東京医科歯科大学）		 日   　   　
＜閉会の辞＞        
16:30-17:00 閉会の挨拶